Das Adeptus Ministorum ist formal nicht Teil des Adeptus Terra. Es ist vielmehr eine Schwesterorganisation, die Hand in Hand mit den Dienern der Erde arbeitet. Das Adeptus Ministorum erhält seine Macht und Autorität aus dem weit verbreiteten Glauben an die Göttlichkeit des Imperators. Es ist nach seinem obersten Hohepriester, dem Ekklesiarchen, auch als Ekklesiarchie bekannt und ist ebenso gewaltig wie mächtig. Seine Aufgabe besteht darin, die zahllosen Wege zu formalisieren und zu deuten, die die Menschheit gefunden hat, um den Imperator zu verehren, und die Myriaden von Welten, die die Menschheit besiedelt hat, auf dem steinigen Weg zwischen Ketzerei und wahrer Frömmigkeit zu führen. Ganze Welten werden von ihm regiert, und auf vielen anderen ist es zumindest die mächtigste imperiale Institution. Wie das Administratum ist die Ekklesiarchie eine komplexe, verschachtelte Organisation. Eine unübersichtliche Hierarchie von Priestern, Beichtvätern, Kardinälen, Novizen, Mönchen, Bischöfen und Missionaren schuldet dem Ekklesiarchen in seinem Palast auf der Erde Lehnstreue. Genauso vielfältig sind die verschiedenen Rollen innerhalb des Ministorum, von Wanderpredigern über charismatische Missionare bis hin zu theosophischen Gelehrten. Zwei der berühmtesten Institutionen innerhalb des Adeptus Ministorum sind die Ausbildungswaisenhäuser der Schola Progenium und die Kämpfenden Schwestern des Adeptus Sororitas.
