A Ordem 66 foi um evento no final das Guerras Clônicas no qual soldados clone do Grande Exército da República se voltaram contra os Generais Jedi e os exterminaram, ocasionando a destruição da Ordem Jedi. O evento foi acionado pelo Protocolo Clone 66, uma ordem implantada nos clones pelos Lordes Sith e cientistas Kaminoanos que criaram o exército clone. O protocolo fazia com que os soldados clone violentamente atacassem os Jedi e os enxergassem como ameaças, e era controlado por um bio-chip implantado nos cérebros dos clones durante sua criação; o chip controlava o comportamento dos soldados e, assim, garantia sua obediência. A conspiração, liderada secretamente por Darth Sidious e Conde Dookan, foi quase exposta quando o chip do soldado clone Tup deu defeito, mas todos que souberam da conspiração foram mortos.