Aunque la mayor parte de las tierras del Imperio están controladas por los Grandes Clanes, hay muchas regiones que quedan fuera del alcance de esas ocho poderosas facciones. Las tres familias imperiales -Otomo, Seppun y Miya- controlan tierras y castillos propios, y la Hermandad de Shinsei administra templos y santuarios por todo el Imperio. Existen incluso algunas fortalezas independientes, gobernadas por ronin o incluso por campesinos, aunque éstas tienden a caer en la órbita de uno u otro de los Grandes Clanes a lo largo de la historia.