Le roi est mort ! La saison commence par nos trois héros, Mira El Nath, Raouh et Bao Bontien prison. Accusés du meurtre par les Magister, ils croupissent en prison quand un cataclysme frappe la ville d'Aurora ! Asterra (4) semble avoir ouvert un portail gigantesque, avec l'aide du Maelstrom, pour transporter une partie de la ville de Darma sur Aurora !
La reine Lystra Valentina Astra, elle aussi en fuite et cachée dans le château, leur vient en aide pour les délivrer. Elle leur dit de se rendre en Mérosie pour y retrouver Jakalondi Behatus Cid. Ce dernier possède un objet qui pourrait bien prouver l'ascendance impériale de Raouh, qui daterait d'avant le Maelstrom. Les pays divisés, lui seul pourrait les rassembler face à la menace qu'Artémisia a révélé.
Fuyant la catastrophe, le groupe retrouve Annie ainsi que Nakia et Kai An'Bereth, transporté ici par le Maelstrom. Le groupe s'échappe par le flanc de la montagne jusqu'à arriver, après plusieurs jours de marche, dans la cité abandonnée de Cimmura. Là, ils conjurent le mal qui retenait la ville prisonnière depuis des siècles, libérant l'esprit des anciens habitants et l'arbre-monde Naya. Celle-ci confie à Raouh, proche de la nature, le soin de replanter ses graines sur chaque continent afin d'étendre à nouveau ses racines partout. Mira El Nath découvre également que c'est dans cette ville qu'ont été créés les arcanas Sera et Surya, deux soeurs et frères. Chaque Arcana était précédemment une véritable personne, puissante, sacrifiée pour vaincre le Maelström.
Reprenant la route, les héros grimpent sur une tortue géante réveillée par Naya. Elle les dépose en Mérosie (5), où leur repos est perturbé par le passage d'aéronef de guerre boréaliens en direction d'Asterra (4). La guerre va bientôt débuter. Pressant le pas, le groupe arrive à Cydia, l'une des cinq cités de la Mérosie, par-delà Les Champs Rouges. Ils sont escortés par Sestia, Poing de l'Aube, et y trouvent l'arbre mort de Naya. Raouh lui redonne la vie, accomplissant une partie de la quête que lui a confié l'arbre-monde. Mira y retrouve sa grand-mère, Unknown, portée disparue suite à une tempête de Maelström.
Apprenant que Jakalondi Behatus Cid se trouvait dans la cité flottante dans les nuages de Silmar, le groupe cherche un moyen de s'y rendre en volant. Bao Bonti utilise sa ruse et remporte le Silver Hook contre la capitaine Shanny Aò Yìn , en échange de la réparation de son appareil. Sur le chemin du retour, ils découvrent la cité technologique et spirituelle de Grerachi, abandonnée depuis des siècles, mais qui délivre des révélations formidables : elle renferme le savoir de l'histoire du monde sur ses murs, jusqu'à la Grande catastrophe du Maelström. Celui-ci est la résultante d'une Fracture de l'Horizon, un événement qui a scindé la réalité en plusieurs mondes suite à la mort de la mystique Serpentaire il y a 500 ans. Ce titre, toujours porté en Asterra (4), est bien plus important qu'il ne semble l'être aujourd'hui. Les paroles de Unknown à Cydia font alors écho : Mira El Nath est désignée depuis sa naissance par les étoiles pour être la prochaine Serpentaire...
Le groupe vole alors jusqu'à Silmar où ils recontrent enfin Jakalondi Behatus Cid. Il confie alors l'épée des Rois à Raouh pour tester sa filiation, car seuls les descendants des Hida peuvent sortir l'arme du fourreau magique. Le jeune garçon y parvient sans difficulté, prouvant qu'il est bien l'héritier de l'ancien empire du monde. C'est alors que le château flottant de Tashi Kiyosa se rapproche de l'île volante de Silmar et qu'une force mécanique surpuissante déferle sur la ville ! Leur maîtresse apparaît, une sorcière du nom d'Inej, qui clâme avoir tué Mira El Nath quand elle était petite pour mettre fin au cycle des Serpentaires... Alors qui est cette jeune femme ?
En pleine bataille, un portail s'ouvre laissant entrer Artémisia et, surprise, Alaryk Calluin ! Ces derniers permettent aux héros de s'enfuir en leur disant que la mère de Mira sait tout. Le groupe affronte un gigantesque robot mais parviennent à évacuer la ville, laissant leur ancienne ennemie et le protecteur à la merci de la sorcière...